Od početka pandemije, dijagnostičko testiranje ima vitalnu ulogu u kontroli širenja SARS-CoV-2, virusa koji uzrokujeCOVID 19.Brzi antigenski testovikoje se izvode kod kuće ili u kliničkom okruženju daju rezultate za 15 minuta ili manje.Što se ranije osobi postavi dijagnoza, to prije može potražiti liječničku pomoć i izolirati se od drugih.Ali kada se pojave nove varijante virusa, te varijante možda neće biti otkrivene ovim testovima.
Većina brzih antigenskih testova dizajnirana je za otkrivanje SARS-CoV-2 nukleokapsidnog proteina ili N-proteina.Ovaj protein se nalazi u izobilju u virusnim česticama i zaraženim ljudima.Komplet za brzi testobično sadrže dva različita dijagnostička protutijela koja se vežu na različite dijelove N proteina.Kada se protutijelo veže za N protein u uzorku, na testnom priboru pojavljuje se obojena linija ili drugi signal, što ukazuje na infekciju.
Protein N se sastoji od 419 strukturnih jedinica aminokiselina.Bilo koja od njih može se mutacijom zamijeniti drugom aminokiselinom.Istraživačka skupina pod vodstvom dr. sc.Philip Frank i Eric Ortlund sa Sveučilišta Emory odlučili su istražiti kako ova promjena jedne aminokiseline utječe na izvedbu brzog antigenskog testa.Koristili su tehniku ​​koja se zove duboko skeniranje mutacija kako bi istovremeno procijenili kako svaka mutacija u N proteinu virusa utječe na vezanje na dijagnostičko protutijelo.Njihovi rezultati objavljeni su u Cellu 15. rujna 2022.
Istraživači su stvorili opsežnu biblioteku od gotovo 8000 mutacija proteina N.Ove varijante čine više od 99,5% svih mogućih mutacija.Zatim su procijenili kako svaka varijanta stupa u interakciju sa 17 različitih dijagnostičkih protutijela korištenih u 11 komercijalno dostupnih brzih antigenskih testova, uključujući uobičajenekućni kompleti.
Tim je procijenio koje mutacije N-proteina utječu na prepoznavanje antitijela.Na temelju tih informacija, stvorili su "profil escape mutacije" za svako dijagnostičko protutijelo.Ovaj profil identificira specifične mutacije u N proteinu koje mogu utjecati na sposobnost antitijela da se veže na svoju metu.Analiza je pokazala da antitijela koja se koriste u današnjim brzim testovima prepoznaju i vežu sve prošle i sadašnje varijante SARS-CoV-2 zabrinjavajuće i zabrinjavajuće.
Iako nekoliko dijagnostičkih antitijela prepoznaje istu regiju N proteina, istraživači su otkrili da svako antitijelo ima jedinstveni potpis escape mutacija.Kako virus SARS-CoV-2 nastavlja mutirati i generirati nove varijante, ti se podaci mogu koristiti za označavanje antitijela u kompletu za testiranje koja će možda trebati ponovno procijeniti.
"Točna i učinkovita identifikacija zaraženih pojedinaca ostaje ključna strategija za ublažavanje COVID-19, a naša studija pruža informacije o budućim mutacijama SARS-CoV-2 koje bi mogle ometati otkrivanje", rekao je Ortlund."Ovdje navedeni rezultati omogućuju nam brzu prilagodbu ovom virusu dok se nove varijante nastavljaju pojavljivati, predstavljajući neposredne kliničke i javnozdravstvene implikacije."
Pozadina: dubinsko skeniranje mutacija otkriva escape mutacije u nukleokapsidu SARS-CoV-2 pomoću trenutno dostupnih brzih testova antigena.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA ćelija.15. rujna 2022.;185(19):3603-3616.e13.Ministarstvo unutarnjih poslova: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. kolovoza 2022. PMID: 36084631.
Financiranje: Nacionalni institut za biomedicinsko oslikavanje i bioinženjering NIH (NIBIB), Nacionalni institut za dijabetes, probavne i bubrežne bolesti (NIDDK) i Nacionalni institut za alergije i zarazne bolesti (NIAID), Američko udruženje za srce.
NIH Research Matters tjedno je ažuriranje ključnih nalaza istraživanja NIH-a koje su pregledali stručnjaci NIH-a.Izdaje ga Ured za komunikacije i odnose s javnošću ravnatelja Nacionalnog instituta za zdravlje.